成熟的肽聚糖链上通过与结合蛋白(Penicillin-binding proteins, PBPs)的结合抑制转肽作用,使得肽聚糖合成减少,自溶素水平升高, 促进细胞溶解和死亡; 氨基糖苷类抗生素结合到核糖体 30S 亚基特定位点上,造成延伸中的肽链上错误插入氨基酸,使得蛋白发生错译以及错误折叠;喹诺酮类抗生素则通过与细菌两种 IIA 型拓扑异构酶的结合干扰 DNA 超螺旋结构, 造成 DNA 双链断裂,并通过依赖新蛋白合成或不依赖新蛋白合成途径造成细菌死亡。
直到 2007 年,Collins 团队提出不同种类的抗生素可能通过激活呼吸链电子传递,诱导大量的活性氧(ROS) 积累进而参与杀菌,并证实在这一过程中,三羧酸循环(TCA) 、NADH 的氧化、铁硫簇(Fe-S cluster)的破坏以及 Fenton 反应均涉及羟自由基的产生与杀菌 。
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