在这两项研究中,澳大利亚悉尼嘉万研究所(Garvan Institute)的Sue Clark及其同事以及荷兰内梅亨大学(Radboud University)的Hendrik Stunnenberg及其同事对染色质免疫沉淀且经过亚硫酸氢盐处理的DNA进行测序。利用相同的DNA来评估胞嘧啶和组蛋白标记,从而克服了不同批次细胞之间的异质性问题,并能对标记之间的相互作用作出更直接的评估。通过ChIP来靶定基因组的特定区域,也能避免全基因组亚硫酸氢盐测序带来的高额费用。
为了让这种方法行之有效,研究小组需要优化他们的亚硫酸氢盐处理步骤,以便接受免疫沉淀所产生的少量DNA。Clark谈道:“主要的改进是让亚硫酸氢盐处理没那么剧烈,并能处理75到00 ng DNA。”他们的方法很相似,并使得几乎00%的未修饰胞嘧啶发生转化。
两个小组都利用这种技术研究了组蛋白H3第27位赖氨酸上*基化(H3K27me3)与DNA甲基化之间的串扰(cross-talk)。过去的研究表明,这两种标记在CpG岛上是互相排斥的。一种理论假设,DNA甲基化是一种更为*的标记,它取代了干细胞分化期间的H3K27me3。Stunnenberg小组的研究结果证实了这种对抗,而Clark小组则认为DNA甲基化和H3K27me3并不总是相互排斥,可以基因组区域依赖的方式共存。他们采用了不同的细胞系,这可能解释了他们的不同结果。
据Clark 介绍,BisChiP-seq方法可与富集目标ELISA试剂盒DNA的任何方法共同使用,且结果是链特异的,提供了等位基因的分辨率。Clark下一步考虑研究其他组蛋白标记及基因组结合因子,以便了解它们与DNA甲基化组的直接关系。
00300-20000 对照品 含量测定 50mg
0030-9990 阿司咪唑 对照品 含量测定 50mg
00302-20000 对照品 含量测定 50mg
00304-200502 对照品 含量测定 00mg
00305-200502 对照品 含量测定 00mg
00306-20020 枸橼酸氯己定 对照品 鉴别 50mg
00307-20020 对照品 含量测定 50mg
00309-20000 氢 对照品 含量测定 50mg
ELISA试剂盒0030-20020 对照品 含量测定 50mg
003-20020 3,5-二氨基-6-氯吡嗪-2-羧酸甲酯 对照品 检查 50mg
032-000 苯噻啶 对照品 检查 50mg
0033-20030 对照品 检查 50mg
0034-200402 对照品 含量测定 00mg
0035-20000 对照品 检查 50mg
0036-200402 E-异构体 对照品 检查 30mg
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